- Vinculado al caso Masacre de Accomarca (1985) por presunto encubrimiento según testigo sentenciado
- Denunciado por presunta colusión en contratos de buffet del Congreso (2023)
- Cuestionado por operación del cártel de Tijuana en Piura durante su jefatura militar (2004-2005)

José Daniel Williams Zapata
Avanza País - Partido de Integración Social
Resumen de controversias
Análisis de las polémicas más relevantes asociadas a José Daniel Williams Zapata, basado en información pública y fuentes periodísticas.